引言
糖基磷脂酰肌醇(GPI)錨定蛋白參與較多生物學(xué)過程,如膜相關(guān)酶活性、細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞粘附和抗原呈遞等。GPI錨定蛋白生物合成過程的異常通常引發(fā)多種疾病,如陣發(fā)性夜間血紅蛋白尿、智力障礙和癲癇發(fā)作等。
2024年1月,中科院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心(上海生化細(xì)胞所)與復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院/附屬口腔醫(yī)院屈前輝課題組在《Nature Communications》發(fā)表了Molecular basis of the inositol deacylase PGAP1 involved in quality control of GPI-AP biogenesis的研究論文(點(diǎn)擊文末閱讀原文查詢文章)。文中利用高效液相色譜(HPLC)系統(tǒng)結(jié)合耐熱綠色熒光蛋白(TGP)表達(dá),設(shè)計(jì)了一種基于熒光檢測(cè)體積排阻色譜(FSEC)的耦合分析方法。這種方法使用賽分科技產(chǎn)品Zenix-C SEC-300體積排阻色譜柱,實(shí)現(xiàn)了脂質(zhì)重塑酶PGAP1底物(TGP3)和最終產(chǎn)物(TGP0)的分離,具有高靈敏度、可重復(fù)性和便利性。
背景介紹
在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中,糖基磷脂酰肌醇錨定蛋白(GPI-APs)在細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞黏附、催化等方面發(fā)揮重要作用,其合成缺陷導(dǎo)致嚴(yán)重的先天性神經(jīng)發(fā)育紊亂。GPI-APs途徑包括合成與重塑兩個(gè)階段,涉及20多步膜內(nèi)催化反應(yīng)。因此,需要闡明這一重要的翻譯后修飾生物發(fā)生過程的分子機(jī)制,以助力其特異性靶向藥物研發(fā)。
目前,對(duì)含有GPI的底物/產(chǎn)物的分析主要依賴于半定量方法,如薄層色譜或SDS-PAGE。但由于GPI-APs脂肪酶成分復(fù)雜,該方法有一定局限性。因此研究團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了一種基于熒光檢測(cè)體積排阻色譜(FSEC)的耦合分析方法,可以實(shí)現(xiàn)PGAP1底物和最終產(chǎn)物的分離。
文章概述
GPI-APs的分泌和質(zhì)量控制需要由進(jìn)化上保守的PGAP1啟動(dòng)的附著后重塑。研究團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了一種基于熒光的新型、簡(jiǎn)便、靈敏的生化分析方法,對(duì)其酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行了表征,并采用哺乳細(xì)胞與酵母細(xì)胞水平的活性體系對(duì)其功能進(jìn)行了鑒定。繼而通過細(xì)胞工程方法,捕捉PGAP1與GPI錨定蛋白的復(fù)合物,并采用冷凍電鏡手段,分析了三個(gè)PGAP1在脂環(huán)境及與產(chǎn)物復(fù)合物的高分辨率結(jié)構(gòu)(2.66−2.84Å),解析了其10-跨膜結(jié)構(gòu)和產(chǎn)物-酶相互作用的機(jī)理,揭示了PGAP1介導(dǎo)GPI-AP脂質(zhì)重塑過程的分子機(jī)制,對(duì)于進(jìn)一步深入理解減數(shù)分裂重組形成過程有著十分重要的意義。
文章選用賽分科技Zenix-C SEC-300體積排阻色譜柱,利用SEC-HPLC系統(tǒng)與TGP熒光相結(jié)合的方式,實(shí)現(xiàn)了PGAP1底物和最終產(chǎn)物的分離,在GPI研究領(lǐng)域潛力巨大。
產(chǎn)物檢測(cè)
將混合物在4°C下以21,000g離心10分鐘,然后采用Zenix-C SEC-300(3μm,300Å)色譜柱進(jìn)行上樣。在482/508nm波長(zhǎng)進(jìn)行熒光檢測(cè)體積排阻色譜(FSEC)的監(jiān)測(cè)。TGP0(產(chǎn)物)可以通過使用已知量的TGP0獲得校準(zhǔn)的FSEC峰強(qiáng)度來量化。
圖1.不同條件處理TGP的FSEC結(jié)果
圖1顯示了cPGAP1、PI-PLC、PI-PLC分別加20、50 ng的cPGAP1以及不加酶處理TGP3的FSEC結(jié)果,結(jié)果顯示,Zenix-C SEC-300體積排阻色譜柱能夠從游離TGP中分離出來自偶聯(lián)反應(yīng)的產(chǎn)物(TGP0),該產(chǎn)物以cPGAP1-、PI-PLC-和劑量依賴的方式出現(xiàn)。
圖2.是否采用PI-PLC處理各冷凍電鏡樣品的FSEC曲線對(duì)比
圖2是PI-PLC對(duì)不同冷凍電鏡樣品影響的圖譜(單次實(shí)驗(yàn))。FSEC分析顯示,樣品中有很大一部分TGP3被水解成TGP2,TGP2通過過量的PI-PLC轉(zhuǎn)化為TGP0。TGP2和TGP3(~30kDa)都攜帶酰基鏈,因此可以形成detergent mcelles形式(~70kDa),減少了在Zenix-C SEC-300體積排阻色譜柱中的保留時(shí)間,從而實(shí)現(xiàn)PGAP1底物(TGP3)和最終產(chǎn)物(TGP0)的分離。
實(shí)驗(yàn)結(jié)論
該研究設(shè)計(jì)了一種基于熒光檢測(cè)體積排阻色譜(FSEC)的耦合分析方法,采用Zenix-C SEC-300體積排阻色譜柱實(shí)現(xiàn)了PGAP1底物(TGP3)和最終產(chǎn)物(TGP0)的分離,可以滿足實(shí)驗(yàn)要求,助力GPI相關(guān)分子機(jī)制的探究。
產(chǎn)品介紹
賽分科技SEC系列色譜柱,采用特有的表面修飾技術(shù),分離速度快,分辨率高,通用性好,批次重現(xiàn)性強(qiáng),適用于質(zhì)控QC放行,也是分析型SEC值得信賴的產(chǎn)品。
圖3.賽分科技SEC固定相表面修飾工藝
“-C”系列產(chǎn)品,采用賽分科技獨(dú)有的固定相修飾工藝,硅膠表面鍵合一層“平躺”的單分子層,最大程度減少非特異性相互作用。適用于疏水性較強(qiáng)的樣品,可以減少有機(jī)相的使用,“-C”系列產(chǎn)品安全、環(huán)保,讓您的實(shí)驗(yàn)無后顧之憂。
賽分科技SEC系列色譜柱,分離范圍廣,適用于多種細(xì)分領(lǐng)域,下表是部分產(chǎn)品的分離范圍。
表1.賽分科技SEC色譜柱分離范圍